سیستم کنترل اقلیم و فرمان مجموعه­ای از سخت افزارها و نرم­ افزارهایی می­باشد که باتوجه به کنترل تجهیزات در گلخانه بهره برداری آسان، راندمان بالا و کاهش خطاهای انسانی طراحی شده و در داخل گلخانه نصب می­گردد. سیستم کنترل اقلیم و فرمان در نظر گرفته شده برای این مجموعه امکان کنترل و مدیریت چهار گلخانه و سیستم اقلیمی مجزا را بطور هم زمان ایجاد می­کند. این سیستم براساس پردازشگرهای تمام میکروکنترلر طراحی و ساخته شده است که بر روی آن یک صفحه نمایش لمسی جهت راحتی در برنامه ریزی و راهبری سیستم­ها وجود دارد. رابط نرم افزاری مربوطه باعث ارتباط سیستم فرمان با کامپیوتر مرکزی بوده و تمامی گزارشات معمول از این طریق قابل دسترسی خواهد بود. کنترل اقلیم سیستم تهویه سقفی، سیستم سایبان، سیستم انرژی سیوینگ، سیستم فن­های سیرکوله، سیستم گرمایش، سیستم فوگر، پمپ پدها، آبریز پدها، فن­های تهویه، سیستم تزریق CO2  را تحت پوشش و کنترل خود قرار می­دهد. این سیستم فرمان قادر است به کمک سنسورهای دما، رطوبت، نور، جهت باد و سرعت باد و با توجه به تنظیمات اعمال شده وضعیت­های تمامی سیستم­ها را به صورت اتوماتیک کنترل نماید. لازم به ذکر است که در این سیستم کنترل اقلیم عملکرد سیستم­های مختلف را می­توان مستقل از هم تعریف نمود و برای هر کدام تنظیمات متفاوتی را اعمال نمود.